Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MED28Q9H204 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MED28Q9H204 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms