Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC2P3Q9BVR0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC2P3Q9BVR0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms