Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP58Q9BVL2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms