Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP2Q9BSJ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms