Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC22CQ9BRL7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC22CQ9BRL7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms