Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RUFY1Q96T51 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms