Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF396Q96N95 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF396Q96N95 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms