Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C2orf48Q96LS8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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C2orf48Q96LS8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C2orf48Q96LS8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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