Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms