Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZC2HC1AQ96GY0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms