Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms