Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM18Q96B42 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM18Q96B42 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms