Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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TRIM63Q969Q1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM63Q969Q1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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