Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DPF3Q92784 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DPF3Q92784 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms