Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BEST2Q8NFU1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms