Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8N9G6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8N9G6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8N9G6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8N9G6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8N9G6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q8N9G6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q8N9G6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q8N9G6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q8N9G6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q8N9G6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q8N9G6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q8N9G6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q8N9G6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q8N9G6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q8N9G6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q8N9G6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms