Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 TCF3-219ENST00000610756 1343 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.581e-6■■■□□ 16.6
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AGGF1Q8N302 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 16.6
AGGF1Q8N302 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■■□□ 16.6
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AGGF1Q8N302 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 16.6
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AGGF1Q8N302 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-7■■■□□ 16.5
AGGF1Q8N302 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.746e-12■■■□□ 16.5
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AGGF1Q8N302 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 220.62■□□□□ 0.894e-6■■■□□ 16.5
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AGGF1Q8N302 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.033e-7■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 VPS41-208ENST00000448833 711 ntTSL 1 (best)6.65□□□□□ -1.343e-7■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.513e-7■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 VPS41-212ENST00000482217 951 ntTSL 55.56□□□□□ -1.523e-7■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-8■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-8■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.111e-8■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.11e-8■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-8■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-8■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RAB17-210ENST00000477149 3211 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.11e-8■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-7■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.386e-13■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.326e-13■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.016e-13■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 FBXO21-206ENST00000550180 2554 ntTSL 512.74□□□□□ -0.376e-13■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 59.94□□□□□ -0.825e-6■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 37.41□□□□□ -1.225e-6■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.335e-6■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.223e-11■■■□□ 16.4
AGGF1Q8N302 HUWE1-206ENST00000463852 586 ntTSL 29.75□□□□□ -0.852e-11■■■□□ 16.4
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