Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRAIDQ6UW56 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRAIDQ6UW56 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms