Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHC4Q6S5L8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms