Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS9Q3SYG4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms