Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms