Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSPP1Q1MSJ5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms