Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CARTPTQ16568 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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