Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD3Q0VAK6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms