Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCK1Q08629 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCK1Q08629 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCK1Q08629 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCK1Q08629 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCK1Q08629 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPOCK1Q08629 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCK1Q08629 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms