Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PUDPQ08623 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUDPQ08623 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms