Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TGM3Q08188 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms