Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD164Q04900 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms