Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TOP2BQ02880 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2BQ02880 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms