Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MS4A2Q01362 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MS4A2Q01362 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms