Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FANCCQ00597 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms