Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB1AP62820 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms