Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK4P51957 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK4P51957 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK4P51957 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK4P51957 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK4P51957 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms