Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB5CP51148 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms