Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A4P43007 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms