Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCSHP23434 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GCSHP23434 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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GCSHP23434 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GCSHP23434 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GCSHP23434 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GCSHP23434 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GCSHP23434 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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