Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD8P13378 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms