Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF5P13349 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF5P13349 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF5P13349 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF5P13349 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYF5P13349 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYF5P13349 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYF5P13349 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYF5P13349 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYF5P13349 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms