Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH1P12830 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH1P12830 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH1P12830 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH1P12830 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDH1P12830 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDH1P12830 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDH1P12830 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDH1P12830 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDH1P12830 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDH1P12830 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDH1P12830 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH1P12830 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH1P12830 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms