Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPM2P07951 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPM2P07951 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM2P07951 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms