Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTMAP06454 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTMAP06454 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTMAP06454 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTMAP06454 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTMAP06454 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTMAP06454 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTMAP06454 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTMAP06454 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTMAP06454 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTMAP06454 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTMAP06454 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTMAP06454 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms