Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF40AO75400 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms