Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PLXNB1O43157 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms