Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 BCAP31-204ENST00000429550 684 ntTSL 321.14■□□□□ 0.971e-29■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 NET1-206ENST00000486354 599 ntTSL 317.04■□□□□ 0.324e-19■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 NET1-203ENST00000449083 637 ntTSL 517.04■□□□□ 0.324e-19■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 NET1-202ENST00000380359 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.634e-19■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-207ENST00000598901 562 ntTSL 425.16■■□□□ 1.621e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.351e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.231e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.21e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.681e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-204ENST00000594993 564 ntTSL 418.55■□□□□ 0.561e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF584-206ENST00000596921 591 ntTSL 417.94■□□□□ 0.461e-10■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.941e-53■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-53■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-53■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31e-53■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 410□□□□□ -0.811e-53■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF740-204ENST00000552593 966 ntTSL 325.51■■□□□ 1.673e-9■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 FUCA2-202ENST00000367585 646 ntTSL 418.92■□□□□ 0.629e-16■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.239e-16■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.531e-11■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PEMT-207ENST00000461404 591 ntTSL 523.14■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PEMT-208ENST00000472446 473 ntTSL 323.04■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PEMT-212ENST00000580147 708 ntTSL 322.62■■□□□ 1.211e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.211e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PEMT-205ENST00000421096 662 ntTSL 314.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 MIPEP-204ENST00000469167 984 ntTSL 521.57■■□□□ 1.041e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.691e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 CCDC69-205ENST00000521308 3323 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.171e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 INHBE-202ENST00000547970 1056 ntTSL 315.53■□□□□ 0.081e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 INHBE-203ENST00000551553 1228 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.011e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 SMC1A-204ENST00000463684 880 ntTSL 214.12□□□□□ -0.159e-54■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.165e-18■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 CCDC69-201ENST00000355417 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 ARF5-203ENST00000459680 466 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.721e-13■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 CCDC69-204ENST00000519740 291 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-10■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.249e-54■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.319e-54■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 CCNG1-212ENST00000512532 540 ntTSL 24.71□□□□□ -1.661e-16■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 METTL7A-205ENST00000550502 618 ntTSL 516.33■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 METTL7A-201ENST00000332160 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 METTL7A-203ENST00000548553 4076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 58.08□□□□□ -1.125e-14■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.135e-14■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 ARL2BP-202ENST00000562023 547 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.731e-9■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.863e-11■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 SH3BP1-202ENST00000417536 2858 ntTSL 220.33■□□□□ 0.853e-11■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 SH3BP1-206ENST00000469947 2612 ntTSL 214.69□□□□□ -0.061e-323■■■■■ 35.8
DDX3XO00571 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.861e-64■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-203ENST00000439080 1388 ntTSL 217.66■□□□□ 0.421e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 514.66□□□□□ -0.061e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-215ENST00000613864 584 ntTSL 414.2□□□□□ -0.141e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-204ENST00000472476 1001 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-207ENST00000476201 929 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TARDBP-205ENST00000473118 701 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.336e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.116e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.896e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.786e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.737e-14■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZMYM2-204ENST00000382881 1912 ntTSL 225.86■■□□□ 1.736e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASSF1-208ENST00000488024 1385 ntTSL 225.68■■□□□ 1.76e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 324.76■■□□□ 1.556e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.556e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASSF1-206ENST00000478619 2060 ntTSL 224.62■■□□□ 1.536e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC136-208ENST00000472049 253 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.58■■□□□ 1.536e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC136-203ENST00000459946 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.58■■□□□ 1.536e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.527e-14■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.49e-24■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.352e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASSF1-207ENST00000482447 1711 ntTSL 1 (best)23.36■■□□□ 1.336e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.336e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LEMD2-202ENST00000421671 2323 ntTSL 323.32■■□□□ 1.326e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.299e-24■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.289e-24■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POGLUT1-203ENST00000460339 589 ntTSL 422.91■■□□□ 1.262e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.236e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.22e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.172e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 222.07■■□□□ 1.122e-28■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.17e-22■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.046e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.986e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.956e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MARVELD1-203ENST00000434038 690 ntTSL 320.94■□□□□ 0.946e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EPHX1-203ENST00000445856 567 ntTSL 220.83■□□□□ 0.936e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 320.8■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 420.8■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 35.7
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