RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488024.1

RASSF1-208, Transcript of Ras association domain family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene RASSF1, Length 1,385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1-208ENST00000488024 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.97■■■■■ 7.19
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RASSF1-208ENST00000488024 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.05■■■■■ 5.6
RASSF1-208ENST00000488024 NACADO15069 1562 aa50.04■■■■■ 5.6
RASSF1-208ENST00000488024 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
RASSF1-208ENST00000488024 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.88■■■■■ 5.58
RASSF1-208ENST00000488024 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.83■■■■■ 5.57
RASSF1-208ENST00000488024 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.67■■■■■ 5.54
RASSF1-208ENST00000488024 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.01■■■■■ 5.44
RASSF1-208ENST00000488024 SCRIBQ14160 1630 aa48.59■■■■■ 5.37
RASSF1-208ENST00000488024 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.57■■■■■ 5.37
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RASSF1-208ENST00000488024 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.06■■■■■ 5.28
RASSF1-208ENST00000488024 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.5■■■■■ 5.2
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RASSF1-208ENST00000488024 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.01■■■■■ 5.12
RASSF1-208ENST00000488024 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.69■■■■■ 5.06
RASSF1-208ENST00000488024 SMARCA4P51532 1647 aa46.52■■■■■ 5.04
RASSF1-208ENST00000488024 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
RASSF1-208ENST00000488024 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.23■■■■■ 4.99
RASSF1-208ENST00000488024 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.2■■■■■ 4.99
RASSF1-208ENST00000488024 NCAPD3P42695 1498 aa46.16■■■■■ 4.98
RASSF1-208ENST00000488024 SMARCA2P51531 1590 aa46.16■■■■■ 4.98
RASSF1-208ENST00000488024 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.1■■■■■ 4.97
RASSF1-208ENST00000488024 HMGXB3Q12766 1538 aa45.97■■■■■ 4.95
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RASSF1-208ENST00000488024 WIZO95785 1651 aa45.75■■■■■ 4.91
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RASSF1-208ENST00000488024 NESP48681 1621 aa44.99■■■■■ 4.79
RASSF1-208ENST00000488024 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.93■■■■■ 4.78
RASSF1-208ENST00000488024 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.79■■■■■ 4.76
RASSF1-208ENST00000488024 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.7■■■■■ 4.75
RASSF1-208ENST00000488024 ERCC6Q03468 1493 aa44.69■■■■■ 4.75
RASSF1-208ENST00000488024 CFTRP13569 1480 aa44.59■■■■■ 4.73
RASSF1-208ENST00000488024 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
RASSF1-208ENST00000488024 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.56■■■■■ 4.72
RASSF1-208ENST00000488024 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.52■■■■■ 4.72
RASSF1-208ENST00000488024 PRDM2Q13029 1718 aa44.35■■■■■ 4.69
RASSF1-208ENST00000488024 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.33■■■■■ 4.69
RASSF1-208ENST00000488024 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.29■■■■■ 4.68
RASSF1-208ENST00000488024 CUX2O14529 1486 aa44.23■■■■■ 4.67
RASSF1-208ENST00000488024 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.21■■■■■ 4.67
RASSF1-208ENST00000488024 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.12■■■■■ 4.65
RASSF1-208ENST00000488024 WDR62O43379 1518 aa44.01■■■■■ 4.64
RASSF1-208ENST00000488024 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
RASSF1-208ENST00000488024 TOPBP1Q92547 1522 aa43.62■■■■■ 4.57
RASSF1-208ENST00000488024 ABCC8Q09428 1581 aa43.61■■■■■ 4.57
RASSF1-208ENST00000488024 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.59■■■■■ 4.57
RASSF1-208ENST00000488024 CUX1P39880 1505 aa43.35■■■■■ 4.53
RASSF1-208ENST00000488024 IFT140Q96RY7 1462 aa43.28■■■■■ 4.52
RASSF1-208ENST00000488024 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
RASSF1-208ENST00000488024 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
RASSF1-208ENST00000488024 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.16■■■■■ 4.5
RASSF1-208ENST00000488024 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.49
RASSF1-208ENST00000488024 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
RASSF1-208ENST00000488024 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.06■■■■■ 4.48
RASSF1-208ENST00000488024 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.04■■■■■ 4.48
RASSF1-208ENST00000488024 TOP2BQ02880 1626 aa43.04■■■■■ 4.48
RASSF1-208ENST00000488024 SYNJ1O43426 1573 aa43.03■■■■■ 4.48
RASSF1-208ENST00000488024 SOGA1O94964 1423 aa43.03■■■■■ 4.48
RASSF1-208ENST00000488024 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
RASSF1-208ENST00000488024 WDR97A6NE52 1622 aa42.89■■■■■ 4.46
RASSF1-208ENST00000488024 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.454e-7■□□□□ 11.2
RASSF1-208ENST00000488024 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.77■■■■■ 4.44
RASSF1-208ENST00000488024 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
RASSF1-208ENST00000488024 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.65■■■■■ 4.42
RASSF1-208ENST00000488024 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.62■■■■■ 4.41
RASSF1-208ENST00000488024 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.56■■■■■ 4.4
RASSF1-208ENST00000488024 GRIN2BQ13224 1484 aa42.54■■■■■ 4.4
RASSF1-208ENST00000488024 PBRM1Q86U86 1689 aa42.53■■■■■ 4.4
RASSF1-208ENST00000488024 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.46■■■■■ 4.39
RASSF1-208ENST00000488024 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
RASSF1-208ENST00000488024 CHD1O14646 1710 aa42.4■■■■■ 4.38
RASSF1-208ENST00000488024 OSCARQ8IYS5 282 aa42.36■■■■■ 4.37
RASSF1-208ENST00000488024 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.27■■■■■ 4.36
RASSF1-208ENST00000488024 SYNJ2O15056 1496 aa42.25■■■■■ 4.35
RASSF1-208ENST00000488024 FBLN2P98095 1184 aa42.21■■■■■ 4.35
RASSF1-208ENST00000488024 ADAMTS12P58397 1594 aa42.19■■■■■ 4.34
RASSF1-208ENST00000488024 KIF27Q86VH2 1401 aa42.17■■■■■ 4.34
RASSF1-208ENST00000488024 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
RASSF1-208ENST00000488024 TRIM41Q8WV44 630 aa42.11■■■■■ 4.33
RASSF1-208ENST00000488024 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.07■■■■■ 4.33
RASSF1-208ENST00000488024 GRIN2AQ12879 1464 aa42.01■■■■■ 4.32
RASSF1-208ENST00000488024 IGF1RP08069 1367 aa41.99■■■■■ 4.31
RASSF1-208ENST00000488024 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.93■■■■■ 4.3
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RASSF1-208ENST00000488024 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.87■■■■■ 4.29
RASSF1-208ENST00000488024 NUP160Q12769 1436 aa41.83■■■■■ 4.29
RASSF1-208ENST00000488024 CEP170Q5SW79 1584 aa41.81■■■■■ 4.28
RASSF1-208ENST00000488024 ARHGEF11O15085 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
RASSF1-208ENST00000488024 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.75■■■■■ 4.27
RASSF1-208ENST00000488024 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.75■■■■■ 4.27
RASSF1-208ENST00000488024 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.75■■■■■ 4.27
RASSF1-208ENST00000488024 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.75■■■■■ 4.27
RASSF1-208ENST00000488024 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.73■■■■■ 4.27
RASSF1-208ENST00000488024 SHROOM2Q13796 1616 aa41.54■■■■■ 4.24
RASSF1-208ENST00000488024 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.53■■■■■ 4.24
RASSF1-208ENST00000488024 EEA1Q15075 1411 aa41.48■■■■■ 4.23
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