Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP2O00295 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP2O00295 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP2O00295 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP2O00295 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP2O00295 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP2O00295 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP2O00295 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP2O00295 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP2O00295 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms