Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBXN8O00124 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN8O00124 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms