Protein–RNA interactions for Protein: A4QPH2

PI4KAP2, Putative phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP2A4QPH2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4KAP2A4QPH2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4KAP2A4QPH2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PI4KAP2A4QPH2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PI4KAP2A4QPH2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4KAP2A4QPH2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PI4KAP2A4QPH2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms