Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R4GMQ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R4GMQ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R4GMQ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R4GMQ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R4GMQ9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
R4GMQ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
R4GMQ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
R4GMQ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
R4GMQ9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
R4GMQ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
R4GMQ9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
R4GMQ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
R4GMQ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
R4GMQ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms