Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMC3Q9UQE7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms